Présentation : Un outil conforme aux standards internationaux pour l’extraction de caractéristiques radiomiques d’images médicales
Date
2022-06-02
Auteurs
Résumé
Le cancer est une maladie hétérogène dont les caractéristiques génomiques et phénotypiques uniques diffèrent d’un patient à l’autre, voire d’une région tumorale à l’autre. L’oncologie de précision est donc un domaine important dans la recherche sur le cancer car elle permet d’adopter des traitements particuliers pour chaque patient atteint par le cancer selon son profil génomique. Cette hétérogénéité génomique des tumeurs agressives se traduit par des caractéristiques tumorales hétérogènes à l’échelle anatomique qui peut être capturée en utilisant une analyse quantitative d’image. Cette dernière donnera une capacité à faire des prédictions phénotypiques tumorales précises. L’extraction de ces caractéristiques est connue sous le nom « analyse radiomique » qui est effectuée à l’aide de plusieurs algorithmes mathématiques permettant l’extraction de ces caractéristiques. Une plateforme sous le nom MEDomicsLab qui est un fruit d’une collaboration internationale (MEDomics Consortium) a été développée pour l’extraction des caractéristiques radiomiques à partir des images originales ou préalablement filtrées afin de surligner des caractéristiques discriminantes dans ces images médicales. La validation de ces analyses des images reste un défi majeur. Par conséquent, une collaboration internationale sous le nom IBSI (Image Biomarker Standardisation Initiative) cherche à standardiser l’extraction de ces caractéristiques d’image grâce à la mise en place de plusieurs normes et directives afin d’établir un consensus entre les différentes équipes/universités participantes. La standardisation a été séparée en deux chapitre, IBSI 1 et IBSI 2. L’IBSI 1 cible la standardisation des calculs des caractéristiques radiomiques. En revanche, l’IBSI 2 qui est en cours d’évolution cible la standardisation de l’implémentation de filtres convolutionnels (p. ex. Laplacien de Gaussienne, filtre à base d’ondelettes) ainsi que l’extraction des caractéristiques radiomiques à partir des images préalablement filtrées. Nous avons intégré les procédures établies par l’IBSI à la plateforme MEDomicsLab. Nos résultats montrent un consensus avec la majorité des collaborateurs de l’IBSI pour les deux chapitres. L’outil MEDomicsLab sera mis gratuitement à disposition des chercheurs du Québec. Il est attendu que cet outil permettant d’extraire des caractéristiques radiomiques, à la fois riches et complexes, soit utilisé pour mener des études multicentriques en oncologie de précision.